ESTL on pühendunud kõikide inimeste, sealhulgas haavatavate gruppide, seksuaal – ja reproduktiivtervise ning seksuaalõiguste edendamisele, reproduktiiv – ja seksuaaltervisealase informatsiooni ja kvaliteetsete teenuste kättesaadavusse tagamisele Eestis. Arengukoostöö raames tegeleb ESTL kõigi seksuaal- ja reproduktiivtervisega ning noorsootööga seotud valdkondadega. Samuti korraldavad nad seksuaalhariduslikke loenguid noortele nii koolides, nõustamiskeskustes kui ka noortekeskustes.
ESTL püüdleb selle poole, et Eesti oleks riik, kus kõik inimeste seksuaalõigused on tagatud; kus kõigil inimestel on vabadus teha informeeritud valikuid ning igaühel on võrdne ja vaba ligipääs seksuaal – ja reproduktiivtervisealasele informatsioonile ja teenustele.
